学科建设的目标是指在学科定位、学科队伍、学科研究、人才培养、学科基地、学科管理等方面形成的特色，到达的培养层次和质量，学科平台环境，管理水平以及预期取得的成效。
大学学科建设的内涵:大学是以学科为基础建构起来的学术组织，所以，学科建设是大学的基础性建设，牵涉到学校工作的方方面面。可以说，大学的一切工作都与学科建设有关，但不能由此说大学的一切工作都是学科建设工作。笔者认为，从学科建设的内涵出发来考虑大学学科建设的内容，应主要包括以下几个方面。
1．调整学科布局
学科布局是指学科在大学的分布状况，它不仅决定了一所大学的学科结构，而且决定了大学的功能、特色，影响着学科水平的提升。因此，大学进行学科建设，首先要着手学科布局的调整。
第一，要进行科学定位。所谓定位，就是锁定目标的位置。通常情况下，每个组织都知道自己的目标是什么，关键是不清楚目标所在的位置。大学也是如此。每所大学都知道自己的目标是培养人才、发展科学、服务社会，但往往不清楚自己要培养什么层次、具有什么样的知识和能力结构的人才，发展什么学科以及在什么水平上发展这些学科，怎样服务社会和在什么领域、通过什么方式服务社会。所以，在学科建设的目标定位上，普遍存在着片面追求“高、大、全”，相互模仿、缺乏个性的问题。如综合性、多科性，国际化、开放式，研究型、高水平，世界一流、世界知名、国内一流等，成为学科建设定位上流行的术语。这表明，学科建设如不能正确定位，学科布局的调整就只能是盲从或无所适从。
第二，要从本校实际出发，建构综合化的学科体系。所谓综合化的学科体系，是指能够促进不同学科的文化、精神、制度和思维方式交叉融合的学科布局。建构综合化的学科体系，是培养全面发展的人才的需要，是科学发展以综合为主的规律的要求，是社会服务的需要。当然，建构综合化的学科体系，并不是说学科布局越全越好，因为学科综合化也有程度、层次和水平之分。不同层次和类型的学校，要根据自己的学科实际，有选择地调整学科布局。但不论什么学校，要建构综合化的学科体系，在学科布局上都应涵盖文科、理科和工科三大学科领域。这里的文科、理科和工科，分别指的是人文社会艺术科学、自然科学学科和应用科学。中外著名大学的办学实践证明：办大学，没有文科，办不出氛围；没有理科，办不出水平；没有工科，办不出效益。
当前，我国大学在建构综合化的学科体系上存在着一个误区，即认为学科综合化就是指学科门类齐全。其实，综合化并不等于学科门类齐全。世界著名的研究型、高水平大学大多是综合性大学，但学科门类并不齐全。如哈佛大学、耶鲁大学、芝加哥大学没有工学院，普林斯顿大学没有医学院、商学院、法学院。但另一方面，没有一定数量的人文社会艺术学科、自然科学学科和应用学科也不可能实现学科的综合化。如上述大学在学科布局上基本涵盖了人文社会艺术学科、自然科学学科和应用学科。再如麻省理工学院虽然以工科为主，但它的自然、社会、人文学科的实力也很强，经济学、语言学世界闻名。牛津大学原来以人文学科为主，但现在它的自然、应用学科，如冶金、材料、医学的实力也很雄厚。我国已有不少大学正在朝这个方向努力。如清华大学解放后成为一所多科性的工科大学，自20世纪80年代以来，为建设世界一流大学，学校制定的学科建设目标是“发展工科优势，加速理科与管理学科的发展，完善人文、艺术学科布局，争取在生命学科方面有所突破”。正如时任清华大学校长王大中所说：“没有一流的人文社会科学，清华大学就不可能建设成世界一流大学。”再如中国人民大学是一所以人文社会科学为主的大学，为满足建设世界一流大学的需要，学校制定的学科规划原则是“主干的文科、适当的理科、必要的工科”。用纪宝成校长的话说，就是“我们适当发展理工学科，不是点缀，不是时尚，而是为了实现人文社会科学学科与自然科学学科必要的交叉融合，促进科学的发展和学术的繁荣，同时也是为了在校园内实现文科思维方式与理工科思维方式的结合或融合，形成人文素养与科学精神相结合的有利于人才健康成长的校园氛围”。
2．完善学科组织
学科组织是学科布局的载体，学科发展必须以学科组织为依托。没有一定的学科组织或学科组织设置不合理，学科的发展就会受到很大的制约。我国大学的学科组织由于受1952年院系调整的影响和改革开放后的自我建构、相互模仿，普遍存在着两个方面的问题；一是学院设置过多，院系并存，导致学科分割严重。如北京大学2002年不包括医学部，设有15个学院和15个独立的系，清华大学不包括医学院，有13个学院和5个独立的系，重组后的浙江大学有20个学院，吉林大学有40多个学院。二是院系设置没有层次，不能反映不同性质学科之间的逻辑关系，结果是对所有院系统一要求，违背了不同学科发展的特点和规律。这种状况不仅严重影响学科之间的相互交叉、融合，而且造成不同学科之间的盲目攀比、恶性竞争。
相比之下，国外著名大学的学院设置不仅普遍数量较少，而且各学院之间层次、职责分明，教学、科研互通，合作方便，非常有利于学科的发展。据2002年中外大学校长论坛“大学的专业调整、学科建设、科研与开发工作”课题组对美，英、日、加等国和我国香港地区30所世界著名大学的调查，发现这些大学平均设有9．7个学院，其中，6所大学的学院设置数量在5个(含5个)以下，9所大学的学院设置数为6—10个，设置学院数最多的是密歇根大学和威斯康星大学，分别为17和15个。[5]从学院的职责和相互关系来看，国外著名大学的学院设置一般分为两个层次：第一层次是基础学科所在的学院，一般称为文理学院。也有的自然科学、社会科学、人文科学三者分设。这是大学的基础学院，主要承担本科生的教学任务和从事基础学科的研究生培养及科研工作。第二层次是应用学科所在的学院，即职业学院，如工学院、商学院、医学院、法学院、农学院、教育学院、建筑学院、公共管理学院、新闻学院等。这些学院除工学院外，一般只培养研究生，从事应用学科的研究。通常情况下，一所大学会根据自己的实际只设其中的几个学院，以体现自己的特色。在学院之下，一般设系或研究所等基层学术组织。除此之外，大学和学院还设有许多跨学院或跨系的研究中心，以培养跨学科的研究生和从事跨学科研究。
国外著名大学的这种学科组织建制非常值得我们学习，我国大学应结合实际，积极进行学科组织的改革；一要适当减少学院数量，规范学院设置，提高学院内学科设置的综合性，二是尽快成立本科生学院，把本科教育从与研究生教育、职业教育混为一体的状态中剥离出来，同时加快发展职业学院，把职业学院做大做强，三是根据需要，成立各种跨学科的研究中心或研究院。
3．组建学科队伍
学科队伍是学科建设的主体，学科建设必须依靠学科队伍来实现。没有一支高水平的学科队伍，就不可能建设高水平的学科。
首先，必须坚持以人为本。在学科队伍建设中坚持以人为本，就是要准确把握学者的特点，要认识到“主宰学者工作生活的力量是学科而不是所在院校”，“学者们对学科的忠诚往往大于对事业单位的忠诚”，并根据这个特点着力营造一个尊师重教的校园环境，即宽容的人文环境、宽松的学术环境和宽裕的生活环境。
其次，要注意形成合理的结构。虽然不同的学科有不同的特点，如基础学科的研究强调自由、独立，应用学科的研究注重团队合作，但作为一支队伍，要形成合力，就必须有合理的结构，包括年龄结构、能力结构等。一般而言，一支健全的学科队伍，应有1名学科带头人，3—5名学科骨干和一个包括若干科研助手、事务助手、技术助手在内的支撑体。
第三，要充分发挥学科带头人的作用。拿破仑有一句名言：一群由一只狮子率领的绵羊能够打败一群由一只绵羊率领的狮子。带头人对一支队伍的战斗力具有决定作用。在学科队伍建设中，必须高度重视并充分发挥学科带头人的作用。学科带头人的作用，具体表现在对学科队伍的定向作用、管理作用和整合作用三个方面。
4．确立学科方向
科学发展的无限性决定了任何一个学科都有很多发展方向。任何一个学科组织都不可能在所有的学科方向上争创一流，它必须作出选择。选择学科方向，包括选择学科方向的数量和确立具体的学科方向两个方面。选择学科方向的数量，要根据师资队伍的状况来确定。师资队伍强大、科研水平高，可以多确立几个学科方向；反之，则要少确立几个学科方向，以免力不从心，但至少应保证一支学科队伍有一个明确的学科方向。确立具体的学科方向，要遵循两个原则；一是“顶天”，就是要深入到学科的前沿，学科方向的前沿性，决定了学科建设的时效性；二是“立地”，就是要考虑学科方向建设的可行性，没有可行性，再好的学科方向也没有实际意义。确立学科方向的方法，可以依靠专家群体，采用“头脑风暴法”、“德斐尔法”等。
5．争取和设立学科项目
项目是学科建设的突破口，也是学科建设的得力“抓手”。通过争取重大的战略性、基础性的科研项目、，不仅可以获得有重大影响的科研成果，而且能较好地促进相关学科的师资队伍建设、高水平的研究生培养和研究基地的建设。项目不仅指科研项目，专业、学位点、重点实验室、重点学科、精品课程、国家教学名师、优秀博士论文等都可以看作学科建设的项目。项目的争取，不仅有可能获得学科发展所必需的经费和条件支持，获得大成果，培养大学者，同时，在项目申报和评审过程中，还可以获得有关学科研究方向和突破点的合理性的评价信息反馈，可以在更广泛的范围内传播和扩展学术影响。项目获取的过程，实际上也是学校的学科水平得到国内外同行专家认可、发展和壮大的过程。
学校通过设立项目，既可以达到宏观调控、重点建设的目的，又能提高学科建设经费的使用效益。学校在设立项目时，要考虑到不同学科的特点，既要重视“小科学”，又要重视“大科学”。清华大学在“211工程”“985工程”的实施中，确定了四种类型的重点科研项目：一是以原始性创新为主要目标的基础研究，如“天然煤污染防治与生态优化”、“纳米材料与结构”等，二是以战略高技术及重大攻关为目标的科技创新研究，如“航天清华1号微小卫星”、“生物芯片”等，三是以社会经济发展的重大理论和改革为目标的宏观战略研究，如“黄河断流的成因与对策”、“中国制造”等；四是以推动产业进步和高技术产业发展为目标的重大科技成果转化项目，如“大型集装箱检测系统”、“光盘软硬件技术”等共40多项。这些重点科研项目的实施，推动了一批优势学科的发展。复旦大学在“十五”211工程”重点学科建设过程中，根据已有的基础，着眼于学科的长远发展，将40个国家重点学科融人23个学科建设项目中进行建设，收到了较好的效果。这些项目分为三大类；一是体现传统优势，旨在加强基础学科，促进原创性研究的项目6个；二是发挥学科综合优势，争取在若干方向取得重大突破的项目，包括5个医学与生物学及其他学科结合的项目和4个临床医学与基础医学及其他学科联合攻关解决临床医学重大问题的项目；三是以探索和解决国家及上海经济建设、社会发展中的重大问题为目标的项目8个。
6．建设学科基地
基地是学科发展的物质基础和平台，它可以为学科发展提供良好的实验、研究环境和条件。我国大学在基地建设中存在的突出问题是：部门或个人占有，小而全，低水平重复，利用率低，投资效益差，装备不平衡。要改变这种现状，就需要对基地的建设和管理体制进行改革，按照“统建、专管、共用”的原则，在建设上，坚持高起点、高标准、高水平，确保能为从事前沿性、基础性、应用性较强的高、大、精、深、新的课题研究提供有效的支撑；在管理上，由专门机构和人员负责管理；在使用上，确保基地的通用性、共享性、开放性。
日本筑波大学在基地建设上，为了给学科建设提供强有力的教育和研究支撑，他们把学校的所有为教育和研究服务的设施、机构统一设置为外国语中心、体育中心、农林技术中心、教育机器中心、加速器中心、低温中心、学术信息处理中心、同位素中心等18个中心。这些中心的任务有两条；一是负责保养、管理教育、研究活动所必需的大型、特殊的设施；二是对凡属共同广泛使用的设备、标本资料及有关研究的辅助业务实行集中管理，以提高利用率和效率。我国兰州大学在“九五”211工程”建设中，把用于购买仪器设备的经费分配至各学科点，由各学科点的各个方向自主购买仪器设备并实施管理。这样虽在一定程度上增强了各学科点自主购买仪器设备的自主性，却造成了一定的重复购置。为提高基地建设的水平，兰州大学在“十五”“211工程”重点学科建设项目总经费当中，将2／3以上的经费用于建设成分分析类、形貌与结构分析类、生命科学类3个校级跨学科设备平台，以支撑所有的重点学科建设。在购置上，坚持“必须符合学科建设的整体要求并尽量作到覆盖面广、通用性强、辐射面宽，必须使拟采购的仪器设备与现有仪器设备之间具有相关性和配套性，必须具有先进性、能够立即投入使用，并在学科建设、科学研究和大型项目中发挥作用”的原则；在管理上，成立了由学校主管领导、相关职能部门负责人和有关专家组成的“大型科学仪器管理委员会”和各平台学术委员会，统筹管理，聘请专人操作、维修和技术指导，较好地促进了学校的学科建设。
7．建立学科制度
学科制度是学科建设的主体为保障学科建设的顺利进行，通过一定的程序制定的一系列规则、规定。学科制度是现代大学制度的核心，它包括组织制度、计划制度、资源分配制度、执行制度、检查评估制度、奖惩制度等。当前我国不少大学在学科制度建设上存在的突出问题是，制度不健全，不完善，不少制度不仅与国家的有关法律法规相抵触，而且不同的制度之间也相互矛盾、冲突，致使很多制度无法操作，形同虚设。今后随着依法治校的加强，这方面的问题将会更加突出。所以，学科建设必须重视建立学科制度。建立学科制度，要坚持先进、全面、具有可操作性的原则。
8．营造学科环境
学科环境既是影响学科建设诸要素的集成，又是学科建设的结晶。它既包括大环境(自然环境、政治环境、经济环境、文化环境)，又包括小环境，主要指校园环境，含软(指学术氛围)、硬(指基础设施、科研条件)两个方面，两者结合起来便构成学科的生态环境。大学在营造大环境上作用有限，但在营造小环境上大有可为。大学营造学科环境主要是指营造校园环境，尤其是营造校园软环境。营造校园软环境一要坚持祟尚科学；二要坚持民主管理，三要坚持学术自由。所谓崇尚科学，既包括崇尚自然科学、工程技术科学，又包括崇尚社会科学、人文科学，要防止文理相轻、理工相斥的不良现象。所谓民主管理，既包含少数服从多数，也包含多数保护少数；既要反对个人专制，也要反对大众暴政。所谓学术自由，是指在学术问题上，要秉承“我可以不同意你的观点，但我至死捍卫你说话的权利”的信念。
以上论述的学科建设的八个方面，既不是完全独立、毫不相干的，也不存在依次递进的逻辑关系和时间上的先后顺序，而是相互影响、相辅相成的。在具体建设过程中，各学校要根据重点突破、全面推进的原则，结合本校校情，有计划、有顺序地安排，既不能割裂它们之间的内在联系，孤立地强调某一个方面，也不能不分重点主次，“眉毛胡子一把抓”。
